水噴射泵工作系統由工作水泵或有壓水源、水噴射泵、管路系統、閥門、水氣分離器和測試儀表等組成。常用的系統有兩種安裝方式，垂直安裝與水平安裝。由于大氣相對的水平運動與垂直運動在流態上有較大的差異，所以水噴射泵的安裝方式對它的性能有一定的影響。
垂直安裝時，由于流動比較對稱，阻力損失小，所以傳能效果較好。但是垂直安裝需要一定高度的空間。
水平安裝時，在流動過程中由于重力的影響，氣泡相對的集中在上部，使阻力損失增加。
從安裝高度上考慮，又分為低位安裝和高位安裝。低位安裝時，水噴射泵擴壓器出口斷面比排水池液面高0~2m。由于高度低，安裝比較容易。高位安裝時，水噴射泵擴壓器出口斷面比排水池液面高8~10m。在相同工作壓力條件下，高位安裝比低位安裝泵的吸氣量可以增加30%左右。這是利用水的位能對氣體進行附加壓縮的緣故。
在水噴射泵工作過程中，當工作介質壓力Pw,吸入氣體壓力PA和出口壓力PB發生變化時，會出現工作狀態的變化，這種狀態下有時會不吸氣或吸氣量不能增加等情況，這是由于水噴射泵處于極限狀態與液體汽化和激波等因素有關